Odeljenje održavanja i zaštite puteva bavi se pripremom za izradu planova programa održavanja državnih puteva I i II  reda i prati njihovu realizaciju.

Odgovorno je za kvalitetno održavanje puteva u skladu sa Zakonom o javnim putevima, odobrenim programom i obezbeđenim sredstvima i za izvršenje radova po programu za održavanje i zaštitu puteva. Odeljenje sarađuje sa predstavnicima inspekcije, lokalne samouprave i MUP-a, a takođe vodi računa o izvršenju radova na održavanju i zaštiti puteva po nalozima MUP-a i inspekcijskih organa. Takođe se obavljaju poslovi pribavljanja  potvrda o prijemu tehničke dokumentacije i upotrebne dozvole, učestvuje na tenderima za izbor izvođača na održavanju i zaštiti puteva; predlažu se deonice za projektovanje, periodično održavanje puteva.

U odeljenju se vrše poslovi: zaštite putnog zemljišta (utvrđivanjem vlasništva i prikupljanjem podataka o zauzeću putnog zemljišta koji se dostavljaju nadležnoj službi JP"Putevi Srbije"), organizuje i prati aktivnosti na geodetskom utvrđivanju granice putnog zemljišta, vrši kontrolu ispunjenja uslova iz odobrenja za priključenje na javne puteve, učestvuje u poslovima eksproprijacije i rešavanja imovinsko pravnih odnosa.

Odeljenje za putne objekte je nadležno za periodično održavanje putnih objekata na državnim putevima I i II reda. U periodično održavanje putnih objekata spadaju radovi na rehabilitaciji, rekonstrukciji i izgradnji putnih objekata - mostova. Mostovi, u užem značenju, su objekti koji služe za prelaz puteva preko prepreka sa otvorom ne manjim od 5,0 m.

Odsek za mostove i tunele

Odsek za mostove i tunele upravlja svim aktivnostima vezanim za periodično održavanje mostova i putnih objekata u koje spadaju radovi na otklanjanju složenijih oštećenja na objektima – rehabilitacije, rekonstrukcije i ukoliko je to neophodno i izgradnje novih putnih objekata.

Takođe postoje i Hitni radovi na održavanju putnih objekata, kojim se smatraju svi radovi na otklanjanju iznenadnih pojava ili šteta nastalih usled poplava, zemljoresa...itd., kojima se direktno ugrožava bezbednost saobraćaja.

Odsek za klizišta

Odsek za klizišta i potporne zidove bavi se upravljanjem aktivnostima vezanim za praćenje i evidentiranje klizišta i drugih nestabilnih pojava na državnim putevima I i II reda. U cilju efikasnijeg obavljanja ovih aktivnosti, formiran je posebno specijalizovan tim za praćenje i evidentiranje klizišta, koji prati specifične objekte koji zahtevaju posebnu obradu u smislu praćenja, posmatranja, geoloških istraživanja i donošenja hitnih mera radi zbrinjavanja nastalih oštećenja i raznih patoloških pojava na putu i pored puta