U Odeljenju za zaštitu puteva je:

1. Odsek za kontrolu osovinskog opterećenja.

Odeljenje za zaštitu puteva obavlja sledeće poslove:

• sprovodi aktivnosti na utvrđivanju zauzeća državnog puta, bespravnog izvođenja radova na državnom putu i u zaštitnom pojasu i svih drugih činjenja kojima se bitno oštećuje ili bi se mogao oštetiti državni put ili ometati bezbedno odvijanje saobraćaja na istom,

• bavi se poslovima kontrole ukupne mase i osovinskog opterećenja teških teretnih vozila na mreži državnih puteva.

Odeljenje održavanja i zaštite puteva Niš prostire se na 4.543,462 km državnih puteva I i II reda. na teritorijama Braničevskog, Pomoravskog, Borskog, Zaječarskog, Raškog, Rasinskog, Nišavskog, Topličkog, Pirotskog, Jablaničkog i Pčinjskog okruga.

Bavi se pripremom za izradu planova programa održavanja državnih puteva I i II reda i prati njihovu realizaciju.

Odgovorno je za kvalitetno održavanje puteva u skladu sa Zakonom o javnim putevima, odobrenim programom i obezbeđenim sredstvima i za izvršenje radova po programu za održavanje i zaštitu puteva. Odeljenje sarađuje sa predstavnicima inspekcije, lokalne samouprave i MUP-a, a takođe vodi računa o izvršenju radova na održavanju i zaštiti puteva po nalozima MUP-a i inspekcijskih organa. Takođe se obavljaju poslovi pribavljanja potvrda o prijemu tehničke dokumentacije i upotrebne dozvole, učestvuje na tenderima za izbor izvođača na održavanju i zaštiti puteva; predlažu se deonice za projektovanje, periodično održavanje puteva.

U odeljenju se vrše poslovi: zaštite putnog zemljišta (utvrđivanjem vlasništva i prikupljanjem podataka o zauzeću putnog zemljišta koji se dostavljaju nadležnoj službi JP "Putevi Srbije"), organizuje i prati aktivnosti na geodetskom utvrđivanju granice putnog zemljišta, vrši kontrolu ispunjenja uslova iz odobrenja za priključenje na javne puteve, učestvuje u poslovima eksproprijacije i rešavanja imovinsko pravnih odnosa.